Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms