Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ap3m1Q9JKC8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ap3m1Q9JKC8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ap3m1Q9JKC8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ap3m1Q9JKC8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ap3m1Q9JKC8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ap3m1Q9JKC8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ap3m1Q9JKC8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ap3m1Q9JKC8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ap3m1Q9JKC8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ap3m1Q9JKC8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ap3m1Q9JKC8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ap3m1Q9JKC8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ap3m1Q9JKC8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ap3m1Q9JKC8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ap3m1Q9JKC8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ap3m1Q9JKC8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ap3m1Q9JKC8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ap3m1Q9JKC8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ap3m1Q9JKC8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ap3m1Q9JKC8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ap3m1Q9JKC8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ap3m1Q9JKC8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ap3m1Q9JKC8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ap3m1Q9JKC8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ap3m1Q9JKC8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ap3m1Q9JKC8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms