Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ybx3Q9JKB3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ybx3Q9JKB3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ybx3Q9JKB3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ybx3Q9JKB3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ybx3Q9JKB3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ybx3Q9JKB3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ybx3Q9JKB3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ybx3Q9JKB3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ybx3Q9JKB3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ybx3Q9JKB3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ybx3Q9JKB3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ybx3Q9JKB3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ybx3Q9JKB3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ybx3Q9JKB3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ybx3Q9JKB3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ybx3Q9JKB3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ybx3Q9JKB3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ybx3Q9JKB3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ybx3Q9JKB3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ybx3Q9JKB3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ybx3Q9JKB3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ybx3Q9JKB3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ybx3Q9JKB3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ybx3Q9JKB3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ybx3Q9JKB3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ybx3Q9JKB3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ybx3Q9JKB3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ybx3Q9JKB3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ybx3Q9JKB3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ybx3Q9JKB3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ybx3Q9JKB3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ybx3Q9JKB3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ybx3Q9JKB3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ybx3Q9JKB3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ybx3Q9JKB3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ybx3Q9JKB3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ybx3Q9JKB3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ybx3Q9JKB3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ybx3Q9JKB3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ybx3Q9JKB3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ybx3Q9JKB3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ybx3Q9JKB3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ybx3Q9JKB3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ybx3Q9JKB3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ybx3Q9JKB3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ybx3Q9JKB3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ybx3Q9JKB3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ybx3Q9JKB3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ybx3Q9JKB3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ybx3Q9JKB3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ybx3Q9JKB3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ybx3Q9JKB3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ybx3Q9JKB3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ybx3Q9JKB3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ybx3Q9JKB3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ybx3Q9JKB3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ybx3Q9JKB3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ybx3Q9JKB3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ybx3Q9JKB3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ybx3Q9JKB3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ybx3Q9JKB3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ybx3Q9JKB3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ybx3Q9JKB3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ybx3Q9JKB3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ybx3Q9JKB3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ybx3Q9JKB3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ybx3Q9JKB3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ybx3Q9JKB3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ybx3Q9JKB3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms