Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX4

Zcchc17, Nucleolar protein of 40 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc17Q9ESX4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zcchc17Q9ESX4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms