Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms