Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE8

Tlnrd1, Talin rod domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlnrd1Q9ERE8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tlnrd1Q9ERE8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tlnrd1Q9ERE8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tlnrd1Q9ERE8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tlnrd1Q9ERE8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tlnrd1Q9ERE8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tlnrd1Q9ERE8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tlnrd1Q9ERE8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tlnrd1Q9ERE8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tlnrd1Q9ERE8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tlnrd1Q9ERE8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tlnrd1Q9ERE8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tlnrd1Q9ERE8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tlnrd1Q9ERE8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tlnrd1Q9ERE8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tlnrd1Q9ERE8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tlnrd1Q9ERE8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tlnrd1Q9ERE8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tlnrd1Q9ERE8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tlnrd1Q9ERE8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlnrd1Q9ERE8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlnrd1Q9ERE8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlnrd1Q9ERE8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlnrd1Q9ERE8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlnrd1Q9ERE8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlnrd1Q9ERE8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlnrd1Q9ERE8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlnrd1Q9ERE8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlnrd1Q9ERE8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlnrd1Q9ERE8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlnrd1Q9ERE8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlnrd1Q9ERE8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlnrd1Q9ERE8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlnrd1Q9ERE8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms