Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms