Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG9

Col4a3bp, Collagen type IV alpha-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3bpQ9EQG9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col4a3bpQ9EQG9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a3bpQ9EQG9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms