Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP64

Tnmd, Tenomodulin, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnmdQ9EP64 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TnmdQ9EP64 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TnmdQ9EP64 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TnmdQ9EP64 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TnmdQ9EP64 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TnmdQ9EP64 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TnmdQ9EP64 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TnmdQ9EP64 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TnmdQ9EP64 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TnmdQ9EP64 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TnmdQ9EP64 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TnmdQ9EP64 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms