Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCP2

Slc38a3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a3Q9DCP2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc38a3Q9DCP2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms