Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan4Q9DCK3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms