Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms