Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 383.3 ms