Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBD2

March8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March8Q9DBD2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
March8Q9DBD2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
March8Q9DBD2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms