Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Fundc1Q9DB70 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms