Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms