Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Q9D9H8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Q9D9H8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Q9D9H8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Q9D9H8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Q9D9H8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Q9D9H8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Q9D9H8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Q9D9H8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Q9D9H8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms