Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8W5

Psmd12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd12Q9D8W5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psmd12Q9D8W5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psmd12Q9D8W5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psmd12Q9D8W5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psmd12Q9D8W5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psmd12Q9D8W5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psmd12Q9D8W5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psmd12Q9D8W5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psmd12Q9D8W5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psmd12Q9D8W5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psmd12Q9D8W5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psmd12Q9D8W5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmd12Q9D8W5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmd12Q9D8W5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmd12Q9D8W5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmd12Q9D8W5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmd12Q9D8W5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmd12Q9D8W5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmd12Q9D8W5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmd12Q9D8W5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmd12Q9D8W5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmd12Q9D8W5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmd12Q9D8W5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmd12Q9D8W5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmd12Q9D8W5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmd12Q9D8W5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmd12Q9D8W5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psmd12Q9D8W5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psmd12Q9D8W5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psmd12Q9D8W5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psmd12Q9D8W5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psmd12Q9D8W5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psmd12Q9D8W5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psmd12Q9D8W5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psmd12Q9D8W5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmd12Q9D8W5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmd12Q9D8W5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmd12Q9D8W5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmd12Q9D8W5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmd12Q9D8W5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms