Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8V7

Sec11c, Signal peptidase complex catalytic subunit SEC11C, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec11cQ9D8V7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec11cQ9D8V7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec11cQ9D8V7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec11cQ9D8V7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec11cQ9D8V7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec11cQ9D8V7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sec11cQ9D8V7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec11cQ9D8V7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec11cQ9D8V7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec11cQ9D8V7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec11cQ9D8V7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec11cQ9D8V7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec11cQ9D8V7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec11cQ9D8V7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec11cQ9D8V7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec11cQ9D8V7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec11cQ9D8V7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec11cQ9D8V7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec11cQ9D8V7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms