Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms