Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D8N1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D8N1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D8N1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D8N1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D8N1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D8N1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9D8N1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D8N1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D8N1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D8N1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D8N1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms