Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Chmp4bQ9D8B3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms