Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nop56Q9D6Z1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nop56Q9D6Z1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nop56Q9D6Z1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nop56Q9D6Z1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Nop56Q9D6Z1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nop56Q9D6Z1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Nop56Q9D6Z1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Nop56Q9D6Z1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nop56Q9D6Z1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nop56Q9D6Z1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nop56Q9D6Z1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nop56Q9D6Z1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nop56Q9D6Z1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nop56Q9D6Z1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nop56Q9D6Z1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nop56Q9D6Z1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nop56Q9D6Z1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nop56Q9D6Z1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nop56Q9D6Z1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nop56Q9D6Z1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nop56Q9D6Z1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nop56Q9D6Z1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nop56Q9D6Z1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nop56Q9D6Z1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nop56Q9D6Z1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nop56Q9D6Z1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nop56Q9D6Z1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nop56Q9D6Z1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nop56Q9D6Z1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nop56Q9D6Z1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nop56Q9D6Z1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nop56Q9D6Z1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nop56Q9D6Z1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nop56Q9D6Z1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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