Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5L7

Spsb1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb1Q9D5L7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spsb1Q9D5L7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spsb1Q9D5L7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spsb1Q9D5L7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spsb1Q9D5L7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spsb1Q9D5L7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spsb1Q9D5L7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spsb1Q9D5L7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spsb1Q9D5L7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spsb1Q9D5L7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spsb1Q9D5L7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spsb1Q9D5L7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spsb1Q9D5L7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spsb1Q9D5L7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spsb1Q9D5L7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spsb1Q9D5L7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spsb1Q9D5L7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spsb1Q9D5L7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spsb1Q9D5L7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spsb1Q9D5L7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spsb1Q9D5L7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spsb1Q9D5L7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spsb1Q9D5L7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spsb1Q9D5L7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spsb1Q9D5L7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spsb1Q9D5L7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spsb1Q9D5L7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms