Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930449I24RikQ9D5E3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930449I24RikQ9D5E3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930449I24RikQ9D5E3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930449I24RikQ9D5E3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930449I24RikQ9D5E3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930449I24RikQ9D5E3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930449I24RikQ9D5E3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930449I24RikQ9D5E3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
4930449I24RikQ9D5E3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
4930449I24RikQ9D5E3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930449I24RikQ9D5E3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930449I24RikQ9D5E3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930449I24RikQ9D5E3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
4930449I24RikQ9D5E3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930449I24RikQ9D5E3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930449I24RikQ9D5E3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930449I24RikQ9D5E3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930449I24RikQ9D5E3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930449I24RikQ9D5E3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930449I24RikQ9D5E3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930449I24RikQ9D5E3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930449I24RikQ9D5E3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930449I24RikQ9D5E3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930449I24RikQ9D5E3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930449I24RikQ9D5E3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930449I24RikQ9D5E3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930449I24RikQ9D5E3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930449I24RikQ9D5E3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930449I24RikQ9D5E3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930449I24RikQ9D5E3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930449I24RikQ9D5E3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930449I24RikQ9D5E3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930449I24RikQ9D5E3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930449I24RikQ9D5E3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930449I24RikQ9D5E3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930449I24RikQ9D5E3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930449I24RikQ9D5E3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930449I24RikQ9D5E3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930449I24RikQ9D5E3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930449I24RikQ9D5E3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930449I24RikQ9D5E3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930449I24RikQ9D5E3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930449I24RikQ9D5E3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930449I24RikQ9D5E3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
4930449I24RikQ9D5E3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
4930449I24RikQ9D5E3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms