Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc7Q9D541 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms