Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam90a1bQ9D4F3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam90a1bQ9D4F3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam90a1bQ9D4F3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam90a1bQ9D4F3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam90a1bQ9D4F3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam90a1bQ9D4F3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam90a1bQ9D4F3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam90a1bQ9D4F3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam90a1bQ9D4F3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam90a1bQ9D4F3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam90a1bQ9D4F3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam90a1bQ9D4F3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam90a1bQ9D4F3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam90a1bQ9D4F3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam90a1bQ9D4F3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam90a1bQ9D4F3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam90a1bQ9D4F3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam90a1bQ9D4F3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam90a1bQ9D4F3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam90a1bQ9D4F3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam90a1bQ9D4F3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam90a1bQ9D4F3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam90a1bQ9D4F3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam90a1bQ9D4F3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam90a1bQ9D4F3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam90a1bQ9D4F3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam90a1bQ9D4F3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam90a1bQ9D4F3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam90a1bQ9D4F3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam90a1bQ9D4F3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam90a1bQ9D4F3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam90a1bQ9D4F3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam90a1bQ9D4F3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam90a1bQ9D4F3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam90a1bQ9D4F3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam90a1bQ9D4F3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam90a1bQ9D4F3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam90a1bQ9D4F3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms