Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D5

4933414I15Rik, RIKEN cDNA 4933414I15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933414I15RikQ9D4D5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
4933414I15RikQ9D4D5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933414I15RikQ9D4D5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933414I15RikQ9D4D5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933414I15RikQ9D4D5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933414I15RikQ9D4D5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933414I15RikQ9D4D5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933414I15RikQ9D4D5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933414I15RikQ9D4D5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933414I15RikQ9D4D5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933414I15RikQ9D4D5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933414I15RikQ9D4D5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933414I15RikQ9D4D5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933414I15RikQ9D4D5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933414I15RikQ9D4D5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933414I15RikQ9D4D5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933414I15RikQ9D4D5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933414I15RikQ9D4D5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933414I15RikQ9D4D5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4933414I15RikQ9D4D5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933414I15RikQ9D4D5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933414I15RikQ9D4D5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933414I15RikQ9D4D5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933414I15RikQ9D4D5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4933414I15RikQ9D4D5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933414I15RikQ9D4D5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933414I15RikQ9D4D5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933414I15RikQ9D4D5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933414I15RikQ9D4D5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933414I15RikQ9D4D5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933414I15RikQ9D4D5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933414I15RikQ9D4D5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933414I15RikQ9D4D5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933414I15RikQ9D4D5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933414I15RikQ9D4D5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933414I15RikQ9D4D5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933414I15RikQ9D4D5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933414I15RikQ9D4D5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms