Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms