Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D454 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D454 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D454 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D454 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D454 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D454 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D454 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D454 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D454 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D454 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D454 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D454 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D454 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D454 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D454 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D454 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D454 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D454 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D454 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D454 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D454 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D454 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D454 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D454 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D454 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D454 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D454 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D454 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D454 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D454 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D454 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D454 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D454 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D454 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D454 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D454 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D454 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D454 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D454 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D454 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D454 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D454 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D454 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D454 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D454 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D454 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D454 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D454 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D454 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D454 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D454 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D454 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D454 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D454 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D454 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D454 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D454 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D454 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D454 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D454 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D454 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D454 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D454 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D454 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D454 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D454 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D454 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D454 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D454 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D454 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D454 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D454 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D454 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D454 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D454 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D454 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D454 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D454 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D454 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D454 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D454 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D454 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D454 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D454 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D454 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D454 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D454 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9D454 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9D454 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9D454 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9D454 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9D454 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9D454 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9D454 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9D454 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q9D454 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q9D454 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q9D454 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q9D454 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms