Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed11Q9D2R4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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