Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Y9

Shisal2b, Protein shisa-like-2B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2bQ9D1Y9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisal2bQ9D1Y9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms