Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cmss1Q9CZT6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cmss1Q9CZT6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cmss1Q9CZT6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cmss1Q9CZT6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cmss1Q9CZT6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cmss1Q9CZT6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cmss1Q9CZT6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cmss1Q9CZT6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cmss1Q9CZT6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cmss1Q9CZT6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms