Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT4

Polr3e, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3eQ9CZT4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr3eQ9CZT4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr3eQ9CZT4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Polr3eQ9CZT4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Polr3eQ9CZT4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Polr3eQ9CZT4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Polr3eQ9CZT4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Polr3eQ9CZT4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Polr3eQ9CZT4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Polr3eQ9CZT4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Polr3eQ9CZT4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Polr3eQ9CZT4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr3eQ9CZT4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr3eQ9CZT4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr3eQ9CZT4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr3eQ9CZT4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr3eQ9CZT4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr3eQ9CZT4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr3eQ9CZT4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr3eQ9CZT4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr3eQ9CZT4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr3eQ9CZT4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr3eQ9CZT4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr3eQ9CZT4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr3eQ9CZT4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr3eQ9CZT4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr3eQ9CZT4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr3eQ9CZT4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr3eQ9CZT4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr3eQ9CZT4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr3eQ9CZT4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr3eQ9CZT4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr3eQ9CZT4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr3eQ9CZT4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr3eQ9CZT4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr3eQ9CZT4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr3eQ9CZT4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr3eQ9CZT4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr3eQ9CZT4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr3eQ9CZT4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr3eQ9CZT4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr3eQ9CZT4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr3eQ9CZT4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr3eQ9CZT4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Polr3eQ9CZT4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Polr3eQ9CZT4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Polr3eQ9CZT4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Polr3eQ9CZT4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Polr3eQ9CZT4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms