Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snx7Q9CY18 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Snx7Q9CY18 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx7Q9CY18 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx7Q9CY18 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx7Q9CY18 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx7Q9CY18 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx7Q9CY18 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx7Q9CY18 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx7Q9CY18 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx7Q9CY18 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx7Q9CY18 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx7Q9CY18 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx7Q9CY18 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx7Q9CY18 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx7Q9CY18 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx7Q9CY18 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx7Q9CY18 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx7Q9CY18 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx7Q9CY18 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx7Q9CY18 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx7Q9CY18 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx7Q9CY18 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx7Q9CY18 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx7Q9CY18 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx7Q9CY18 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx7Q9CY18 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx7Q9CY18 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx7Q9CY18 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx7Q9CY18 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx7Q9CY18 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx7Q9CY18 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx7Q9CY18 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx7Q9CY18 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx7Q9CY18 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx7Q9CY18 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx7Q9CY18 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx7Q9CY18 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx7Q9CY18 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx7Q9CY18 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms