Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms