Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CRC3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CRC3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CRC3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CRC3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CRC3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CRC3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CRC3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CRC3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CRC3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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