Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB0

Snx24, Sorting nexin-24, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx24Q9CRB0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx24Q9CRB0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snx24Q9CRB0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snx24Q9CRB0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snx24Q9CRB0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snx24Q9CRB0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snx24Q9CRB0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snx24Q9CRB0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snx24Q9CRB0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx24Q9CRB0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx24Q9CRB0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx24Q9CRB0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx24Q9CRB0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx24Q9CRB0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx24Q9CRB0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx24Q9CRB0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx24Q9CRB0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx24Q9CRB0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx24Q9CRB0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx24Q9CRB0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx24Q9CRB0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx24Q9CRB0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms