Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc43Q9CR29 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc43Q9CR29 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc43Q9CR29 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc43Q9CR29 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc43Q9CR29 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc43Q9CR29 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc43Q9CR29 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc43Q9CR29 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc43Q9CR29 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc43Q9CR29 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc43Q9CR29 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc43Q9CR29 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc43Q9CR29 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc43Q9CR29 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc43Q9CR29 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc43Q9CR29 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc43Q9CR29 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc43Q9CR29 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc43Q9CR29 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc43Q9CR29 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc43Q9CR29 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc43Q9CR29 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc43Q9CR29 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc43Q9CR29 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc43Q9CR29 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc43Q9CR29 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc43Q9CR29 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc43Q9CR29 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc43Q9CR29 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc43Q9CR29 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc43Q9CR29 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc43Q9CR29 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc43Q9CR29 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc43Q9CR29 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc43Q9CR29 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc43Q9CR29 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc43Q9CR29 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc43Q9CR29 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc43Q9CR29 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc43Q9CR29 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc43Q9CR29 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc43Q9CR29 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc43Q9CR29 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc43Q9CR29 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc43Q9CR29 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc43Q9CR29 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc43Q9CR29 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc43Q9CR29 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc43Q9CR29 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc43Q9CR29 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms