Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQV6

Map1lc3b, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3B, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map1lc3bQ9CQV6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms