Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL5

Mrpl18, 39S ribosomal protein L18, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl18Q9CQL5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl18Q9CQL5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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Mrpl18Q9CQL5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl18Q9CQL5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl18Q9CQL5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl18Q9CQL5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl18Q9CQL5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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Mrpl18Q9CQL5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl18Q9CQL5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl18Q9CQL5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Mrpl18Q9CQL5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl18Q9CQL5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl18Q9CQL5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Mrpl18Q9CQL5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl18Q9CQL5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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Mrpl18Q9CQL5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl18Q9CQL5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl18Q9CQL5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl18Q9CQL5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl18Q9CQL5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl18Q9CQL5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl18Q9CQL5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl18Q9CQL5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl18Q9CQL5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl18Q9CQL5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Mrpl18Q9CQL5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl18Q9CQL5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl18Q9CQL5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl18Q9CQL5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Mrpl18Q9CQL5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Mrpl18Q9CQL5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Mrpl18Q9CQL5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Mrpl18Q9CQL5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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Mrpl18Q9CQL5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl18Q9CQL5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl18Q9CQL5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl18Q9CQL5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl18Q9CQL5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl18Q9CQL5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl18Q9CQL5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl18Q9CQL5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl18Q9CQL5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl18Q9CQL5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl18Q9CQL5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl18Q9CQL5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl18Q9CQL5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl18Q9CQL5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl18Q9CQL5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl18Q9CQL5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl18Q9CQL5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl18Q9CQL5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl18Q9CQL5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl18Q9CQL5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl18Q9CQL5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl18Q9CQL5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl18Q9CQL5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl18Q9CQL5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl18Q9CQL5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl18Q9CQL5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms