Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI9

Med30, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 30, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med30Q9CQI9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med30Q9CQI9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med30Q9CQI9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med30Q9CQI9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med30Q9CQI9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med30Q9CQI9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms