Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms