Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
StambpQ9CQ26 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
StambpQ9CQ26 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
StambpQ9CQ26 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
StambpQ9CQ26 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
StambpQ9CQ26 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
StambpQ9CQ26 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
StambpQ9CQ26 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
StambpQ9CQ26 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
StambpQ9CQ26 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms