Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ska1Q9CPV1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms