Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms