Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl3Q99N95 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Mrpl3Q99N95 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Mrpl3Q99N95 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl3Q99N95 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl3Q99N95 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Mrpl3Q99N95 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Mrpl3Q99N95 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Mrpl3Q99N95 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl3Q99N95 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl3Q99N95 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Mrpl3Q99N95 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Mrpl3Q99N95 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl3Q99N95 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl3Q99N95 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl3Q99N95 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl3Q99N95 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl3Q99N95 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl3Q99N95 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl3Q99N95 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl3Q99N95 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl3Q99N95 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl3Q99N95 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl3Q99N95 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl3Q99N95 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl3Q99N95 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl3Q99N95 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl3Q99N95 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Mrpl3Q99N95 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Mrpl3Q99N95 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mrpl3Q99N95 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Mrpl3Q99N95 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl3Q99N95 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl3Q99N95 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl3Q99N95 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl3Q99N95 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl3Q99N95 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl3Q99N95 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Mrpl3Q99N95 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Mrpl3Q99N95 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl3Q99N95 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl3Q99N95 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl3Q99N95 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl3Q99N95 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Mrpl3Q99N95 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl3Q99N95 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl3Q99N95 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl3Q99N95 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl3Q99N95 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl3Q99N95 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl3Q99N95 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl3Q99N95 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl3Q99N95 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl3Q99N95 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl3Q99N95 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl3Q99N95 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl3Q99N95 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl3Q99N95 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl3Q99N95 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl3Q99N95 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl3Q99N95 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl3Q99N95 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl3Q99N95 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl3Q99N95 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl3Q99N95 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl3Q99N95 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl3Q99N95 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl3Q99N95 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl3Q99N95 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl3Q99N95 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl3Q99N95 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl3Q99N95 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl3Q99N95 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl3Q99N95 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms