Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Brms1Q99N20 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms