Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms