Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms